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Este capítulo revisa as estratégias computacionais atuais para explorar os ensembles conformacionais do RNA, discutindo desafios como eficiência de amostragem e precisão de campos de força, ilustrados por estudos de caso, e destaca direções emergentes como a integração com dados experimentais e o uso de aprendizado de máquina para aprimorar a previsão de paisagens energéticas.
Este estudo demonstra que vesículas extracelulares pequenas derivadas do córtex embrionário conferem neuroproteção através de sinalização multipathway mediada pela CaMKIIα, restaurando a estabilidade dos microtúbulos e a respiração mitocondrial em neurônios envelhecidos.
Este estudo revela que o fator de transcrição FOXC1 ativa a expressão de ARHGAP36 para desregular a via de sinalização Hedgehog, identificando níveis elevados de ARHGAP36 como um preditor de melhor sobrevida em pacientes com neuroblastoma.
Este estudo revela que a RNA polimerase de espiroquetas possui uma capacidade reduzida de derreter promotores, compensada pela proteína CarD e caracterizada por um desenlace precoce do elemento -35 e uma ligação não específica e firme ao DNA, elucidando assim mecanismos únicos de regulação transcricional neste filo bacteriano.
Este estudo demonstra que o pulo de oito éxons no gene MDM2, induzido por estresse genotóxico e associado ao câncer, é regulado por elementos conservados em um éxon terminal distal, validando o modelo de "regulón de éxons" e abrindo caminho para novas terapias direcionadas a variantes de splicing.
Os autores desenvolveram um modelo celular reversível e induzível de neurônios com depleção gradual de SIRT6 que recapitula as assinaturas de envelhecimento e neurodegeneração, permitindo a distinção entre alterações fisiológicas reversíveis e patológicas, além de identificar vias críticas como o transporte nucleocitoplasmático comprometido.
Este estudo demonstra que a mutação H2A.Z R80C, que desestabiliza nucleossomos, suprime o fenótipo secretor associado à senescência (SASP) em fibroblastos humanos primários ao reduzir a marcação H3K27ac nos loci dos genes SASP, sem afetar a expressão de genes do ciclo celular.
Este estudo desenvolveu uma linha celular repórter (CHACR) para elucidar os mecanismos de conversão alélica mediada por Cas9 e editores de base, demonstrando que a inibição de DNA-PKcs ou a superexpressão de RAD51 podem modular esse processo para corrigir mutações heterozigotas.
Este estudo demonstra que a levedura *Komagataella phaffii* é uma exceção entre os fungos por possuir dois fatores de transcrição Pho4 funcionais e parcialmente sobrepostos (Pho4A e Pho4B) que atuam em conjunto na adaptação à escassez de fosfato e ao estresse alcalino.
Análises transcriptômicas revelam que tubarões apresentam uma expressão significativamente maior de quatro vias principais de reparo de DNA em comparação com raias e arraias, o que pode conferir a eles maior capacidade de mitigar danos genéticos e sobreviver em oceanos cada vez mais poluídos.
Este manuscrito foi retirado pelos autores para incorporar dados adicionais e realizar uma revisão substancial antes de uma nova submissão, solicitando que não seja citado como referência.
Este estudo desenvolveu e validou uma abordagem terapêutica baseada em oligonucleotídeos antisentido que visa especificamente a variante patogênica do gene EFEMP1, demonstrando eficácia na redução de depósitos extracelulares e acúmulo intracelular de lipídios em um modelo derivado de células de pacientes com distrofia reticular de Doyne.
Este estudo demonstra que a aneuploidia em células cancerígenas promove resistência ao estresse oxidativo e aumenta o potencial metastático através da supressão da PARP1, um processo mediado pela ativação do fator de transcrição CEBPB em resposta à disfunção lisossomal.
Este estudo demonstra que alterações relacionadas à idade na composição e fluidez das membranas neuronais induzem polimorfismos estruturais específicos no α-sinucleína, resultando em fibrilas com maior patogenicidade e respostas celulares distintas, o que esclarece o vínculo entre a dinâmica das membranas e as diferentes manifestações das sinucleinopatias.
Este artigo apresenta duas estratégias de condicionamento sem treinamento, "Interpolate-Integrate" e "Replacement Guidance", que permitem adaptar modelos de fluxo de correspondência 3D para o design bioisostérico de ligantes, preservando características críticas como forma e padrões farmacofóricos sem a necessidade de retreinamento.